1、耐火等级和防火分区
严格控制建筑物的耐火等级十分必要，设计时将厂房的耐火等级定为一、二级，使其建筑构件的耐火性能与甲、乙类生产厂房相适应，从而大大减少了火灾发生的可能性。除此以外，我们还应特别注意洁净室中的环境实验室的顶棚和壁板、洁净生产区与一般生产区间的隔断以及技术竖井等部位的防火处理，要求其必须采用不燃烧体材料，且耐火极限要达到相应技术规范的要求。
2、安全疏散
鉴于洁净室工程自身的特点，我们在设计中应充分考虑人员安全疏散的要求，综合分析疏散人流、疏散路线、疏散距离等因素，通过科学计算，选出最佳疏散线路，合理布置安全出口和疏散通道，建立起一个安全的疏散结构体系，使之满足从生产地点到安全出口不经过曲折的净化路线。
3、采暖通风和防排烟
洁净室内通常都布置有空调通风工程系统，我们在设计时要按规范要求在通风空调管网的适当部位合理设置防火阀，并按要求选好管网材料，做好管网穿墙、穿楼板的防火封堵工作，防止火势随通风空调系统蔓延。同时，应在厂房内设置事故通风排烟工程系统，在疏散走道上设置正压送风的机械排烟系统。
4、消防设施
洁净厂房按规范要求都设置有消防给水、灭火设备和火灾自动报警系统，主要是为了及时发现火灾，将火灾事故消灭在初始阶段。对于洁净室由于其具有技术夹层和用于回风空间的下夹层，我们在布置报警探头时应予考虑，这样更有利于及时发现火情。同时，对于有大量精密和贵重设备的洁净室实验室工程，我们还可以引入VESDA这种早期预警空气采样报警系统
5、装修工程
在无尘车间装修中，我们必须注意装修材料的燃烧性能，尽量减少使用一些高分子合成材料，以避免火灾发生时产生大量烟气，不利于人员逃生。另外，要对电气线路的穿管做严格要求，在有条件的地方要尽量使用钢管，保证电气线路不成为火灾蔓延的途径。